2016年6月20日，第二届中国-中东欧国家卫生部长论坛在江苏省苏州市召开。会上，中国-中东欧国家公共卫生合作机制宣布成立，该机制将有力促进中国疾控中心与中东欧国家级公共卫生对口机构的未来合作。论坛期间，中心王宇主任和立陶宛传染病与艾滋病研究中心主任Saulius  Caplinskas博士在中国国务院副总理刘延东、捷克共和国总理博胡斯拉夫·索博特卡、国家卫生计生委主任李斌及中东欧相关国家部长的见证下签署了机构间合作谅解备忘录。该备忘录提出了重点加强高致病性传染病（如埃博拉、寨卡病毒、中东呼吸综合征和禽流感等）的防控、传染病监测、研究与健康促进、公共卫生应急反应技术支持等领域的合作与交流。通过合作拟促进两机构在以上所述领域的人力资源开发、能力建设，信息交流，